Der MediaPlayer von JavaFX benötigt unter Linux das Paket libavformat54. Diese ist aber ab Debian 8 und Ubuntu ab Version 15 nicht mehr in der Distribution enthalten, sondern nur mit höherer Versionsnummer. Zumindest bei Debian kann man problemlos diese und die Pakete, die davon benötigt werden, nachinstallieren. Hier die Liste aller dazu benötigten Pakete für ein 64bittiges Debian:
        libaac2_2.0.2_dmo5_amd64.deb
        libavcodec54_1.0.10-dmo1_amd64.deb
        libavformat54_1.0.10-dmo1_amd64.deb
        libavutil51_1.0.10-dmo1_amd64.deb
        libfaac0_1.28-dmo5_amd64.deb
        libfdk-aac0_0.1.1_dmo1_amd64.deb
        libgcrypt11_1.5.0-5+deb7u4_amd64.deb
        libgnutls26-2.12.20+deb7u5_amd64.deb
        libmp3lame0_3.99.5_dmo6_amd64.deb
        libopenjpeg2_1.3+dsfg-4.8_amd64.deb
        librtmp0_2.4+20111222.git4e06e21-1_amd64.deb
        libschroedinger-1.0-0_1.0.11-2_amd64.deb
        libssl1.0.0_1.0.1t-1+deb8u7_amd64.deb
        libtasn1-3_2.13-2+deb7u2_amd64.deb
        libvpx1_1.1.0-1_amd64.deb
        libx264-132_0.132.2310+git76a5c3a-dmo1_amd64.deb
Diese Pakete packt man alle in ein Verzeichnis ohne andere Dateien. (Ich habe diese Debianpakete von https://pkgs.org bezogen.) Dann öffnet man ein Terminal und installiert mit Rootrechten diese Pakete mit:
        apt install <Verzeichnis>/*.*
Ist man im Terminal auf das Verzeichnis mit CD gegegangen, ist es nur der Punkt ., ansonsten muss man das vollständige Verzeichnis angeben.
Danach funktioniert der MediaPlayer einwandfrei, ich habe es in zwei Debian9-Installationen ausprobiert.